顯微鏡放大倍數是物鏡的放大倍數與目鏡的放大倍數的乘積，如物鏡為10×，目鏡為10×，其放大倍數就為10×10=100。顯微鏡目鏡長度與放大倍數呈負相關，物鏡長度與放大倍數呈正相關。即目鏡長度越長，放大倍數越低；物鏡長度越長，放大倍數越高。

電子顯微鏡是根據電子光學原理，用電子束和電子透鏡代替光束和光學透鏡，使物質的細微結構在非常高的放大倍數下成像的儀器。

顯微鏡一般具有三個接物鏡，即低倍、高倍及油鏡，固定于接物鏡轉換盤孔中。觀察標本時，先使用低倍接物鏡，此 時，視野較大，標本較易查出，但放大倍數較小（一般放大100倍），較小的物體不易觀察其結構。高倍接物鏡放大的倍數較大（一般放大400倍），能觀察微小的物體或結構。